ZERO3：
2代事件之后数月，反抗组织和政府军间获得了暂时的平静，雪儿的新能量研究顺利进行，如果研究成功，则反抗组织和政府军之间的冲突焦点将不复存在，或许战争将就此画上休止符。
某日一艘外宇宙而来的太空船坠落在地球上，而且从船中发出与黑暗精灵相同的波动。为调查真相，ZERO和雪儿等来到坠落地点调查。调查途中3天王也带兵赶到，不过结局是在飞船中发现了100年前妖精战争后被流放的OMEGA和贝鲁博士，贝鲁博士通过复活的COPY-X控制了政府军，而且派出心腹8审官搜寻黑暗妖精，100年前妖精战争的惨剧即将重演……
