进入隐藏路线（EVA Bad Ending）的方法：
从F前篇（直接接完结篇亦可）到地上篇第62话前，初号机必须要暴走5次或以上（不算最初EVENT）；
38话（未打隐藏关为37话）“ アクシズの攻防”中不要说得カトル（亦即要放弃 W系所有人物）；
在60话（未打隐藏关为59话）“ 異质なるモノへの挽歌”中，一开始便要选择 シンジ出击；
进入地上篇第63话之前，シンジ的同步率应为三人中最高，即在剧情的测试里获得第一；这样他就会在攻打第五使徒的剧情里担任炮手；
达成上述4个条件后，63（62）话后半就会发生绫波自爆的剧情，进入隐藏路线的64（63）话“僕がボクとして生まれた理由”。
完成65（64）话“未完のシ者”之后，游戏结束。
