使Repliod凶暴化的Σ病毒的发生成为起端,经过浩大漫长的"Irregular战争".那个被认作永无休止的战斗,最终在一位英雄"X"的努力下宣告结束,世界也开始走上了复兴的道路.
人类冶Ρσ福生活的理想乡作为目标."Neo Arcadia".作为再生的据点被筑成的城市.人们总算在那里取回笑容…但是,那里对Repliod来说是像地狱般的世界.政府因为害怕Repliod的Irregular化,就以莫明的理由逐各将Repliod们逮捕并加以处分.侥幸逃脱处分的Repliod们隐藏在残破的废旧都市,利用那里残留的稀少的能源生活着.
---------这是序的内容
杰洛:「艾克斯…?这个名字我好象听过」
雪儿:「艾克斯…」
「传说中的英雄其实现在还活著,而且…他现在正想处死我们」
杰洛:「你说艾克斯…想要将你们…处死?」
雪儿:「现在,其实就在我们这么对话的同时…许多无辜机器人已经被他们处死了…」
--------这是杰洛刚到反抗军基地是的对话
问题:X不是Repliod吗,Repliod站在所谓人的立场去处死Repliod?X是政府?